El término de Loeches presenta indicios de ocupación humana desde tiempos remotos. Se han hallado restos líticos que podrían datar del Paleolítico medio, aunque los vestigios más consistentes corresponden al Calcolítico (c. 3000 a.C.) en el Cerro del Rollo. Durante la Edad del Bronce, hubo asentamientos en el cerro de la Hijosa, y en la Edad del Hierro, en Valdepozuelo. En torno al siglo IV a.C., los carpetanos establecieron poblados organizados en clanes, como reflejan los hallazgos del cercano Cerro de San Juan del Viso. Se sugiere un origen celta del nombre Loeches, relacionado con términos vinculados al agua. Bajo dominio romano, la zona se integró en la red de calzadas y villas de la Carpetania, destacando la vía Galiana, que atravesaba el término. Se han encontrado vestigios romanos junto al arroyo Pantueña, posiblemente de una villa rural.

Los hechos más representativos de los Siglos XI y XII, comienzan con la conquista cristiana de la región tras la toma de Toledo por Alfonso VI en 1085. En 1088, Loeches pasó a dominio del arzobispo de Toledo, aunque la presión almorávide ocasionó nuevas incursiones islámicas. En 1118, bajo el reinado de Urraca I, se reconquistó definitivamente Alcalá y su alfoz. Loeches quedó englobado en esta estructura eclesiástica, en una época marcada por disputas territoriales entre Toledo y Segovia. En 1190, Alfonso VIII reconoció la pertenencia de Loeches a los castellanos, consolidando su posición en la mitra toledana.

En el Siglo XIII, la repoblación cristiana se consolidó tras la victoria en las Navas de Tolosa (1212). En 1223, el arzobispo Jiménez de Rada otorgó fuero a las aldeas del alfoz de Alcalá, entre ellas Loeches, integrándolas en el señorío eclesiástico de Toledo. El primer núcleo urbano se formó en torno a la iglesia, donde aún se conserva una lápida de 1295 que pudo pertenecer a un Vía Crucis medieval. Loeches encabezaba el “Cuarto de Loeches” o “de Arganda”, una subdivisión administrativa con otras aldeas cercanas.

Del Siglo XIV, aunque hay menos información específica, se sabe que Loeches seguía integrado en la Comunidad de Villa y Tierra de Alcalá. El señorío arzobispal seguía vigente, y se mencionan privilegios antiguos concedidos por reyes anteriores, como el derecho a pasto y leña en los reinos, aunque su autenticidad es dudosa. El núcleo urbano fue creciendo en torno a la iglesia y el sistema administrativo eclesiástico consolidó su control.

A finales del siglo XV, el Cardenal Cisneros reorganizó la administración de las aldeas de Alcalá, ratificando los fueros. Loeches seguía formando parte del Cuarto de Loeches, con una población modesta pero estable. Se mantenían los vínculos con la mitra toledana, y la villa presentaba características de una comunidad agrícola con algunas influencias mudéjares en su arquitectura.

Durante el Siglo XVI, Loeches se emancipó parcialmente de Alcalá. En 1555, el emperador Carlos I confirmó su estatus de villa independiente, separada de la jurisdicción complutense. En 1576, las Relaciones de Felipe II describen un pueblo antiguo, con unos 300 vecinos, una iglesia parroquial renacentista y un hospital de origen incierto. Se menciona un privilegio del siglo XIV, el aumento de población y una economía basada en vino, miel, cera y velas. En 1583, tras la venta del señorío por Felipe II, Loeches pasó a manos de don Íñigo de Cárdenas y su esposa, quienes fundaron el convento de las Carmelitas Descalzas.

En el Siglo XVII, tras la muerte de los Cárdenas en 1633, el señorío pasó a las Comendadoras de Santiago, que lo vendieron al Conde-Duque de Olivares por 17.200 ducados. Este lo eligió como lugar de retiro y construyó el gran Monasterio de la Inmaculada Concepción, donde proyectó su panteón familiar. Se inició el canal de aguas desde Val de Ruines, inaugurado en 1637. Loeches fue escenario del auge del poder nobiliario y religioso, reflejado en sus edificios. A finales de siglo, el pueblo pasó a la Casa de Alba por enlace matrimonial, consolidando así su pertenencia a una de las casas nobiliarias más poderosas de España.

El siglo XVIII comenzó con crisis demográfica: de 300 vecinos en 1576 se pasó a solo 179 en 1712. A mediados de siglo, con los Borbones, hubo una leve recuperación. El Catastro de Ensenada documenta 190 vecinos, 14 nobles y 30 pobres de solemnidad. Se mantienen los conventos, aunque muchas casas estaban deterioradas o inhabitables. La villa seguía aquejada por la escasez de agua y la pobreza agrícola. Sin embargo, surgieron nuevas oportunidades gracias al comercio de esparto y a la industria de las aguas medicinales.

Durante el Siglo XIX, tras la invasión napoleónica, los franceses saquearon el monasterio. En 1812 Las Cortes de Cádiz abolieron los señoríos y Loeches dejó de pertenecer a la Casa de Alba. En 1833, con la reforma territorial de Javier de Burgos, pasó a la nueva provincia de Madrid. El diccionario de Madoz refleja una población empobrecida: 135 vecinos y 123 casas, dos cementerios y un molino aceitero. En 1851 se descubrieron aguas medicinales y se fundó el balneario de “La Margarita”, que fue muy frecuentado a finales de siglo. En 1886 llegó el ferrocarril del Tajuña, que impulsó la cerámica y la expansión urbana. A finales del siglo, Loeches experimentó un repunte demográfico y crecimiento industrial con nuevos edificios públicos de estilo neomudéjar.

En el Siglo XX durante la Guerra Civil, el pueblo fue cuartel republicano y sufrió saqueos y la destrucción parcial de los conventos. En la posguerra se reconstruyeron fuentes y se mejoraron infraestructuras. La segunda mitad del siglo XX marcó el inicio del desarrollismo: la población creció de 948 habitantes en 1960 a más de 2.000 en los 70. Se consolidó el modelo suburbano. El balneario de La Margarita cayó en ruinas, pero se mantuvo la fama de sus aguas. Loeches fue inmortalizado en 1964 por Fernán-Gómez en El extraño viaje. También se construyó el Colegio Monfort, exponente de arquitectura moderna, y se rehabilitó parte del patrimonio industrial.

Durante el siglo XXI, Loeches ha seguido creciendo, hasta alcanzar los 6.000 habitantes en 2005. El urbanismo ha avanzado con nuevas promociones residenciales que han cercado el núcleo tradicional. A pesar de los esfuerzos normativos de conservación, parte del patrimonio histórico ha desaparecido. Las aguas medicinales y los vestigios industriales siguen siendo símbolos del pasado, mientras el casco antiguo se adapta lentamente a las exigencias del presente.